艾学堂 l “数字PCR panel检测”助力肺癌液体活检

导读

靶向治疗在驱动基因阳性的晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者中疗效显著，表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs)已经成为NSCLC的常规治疗。随着临床研究的深入，EGFR的突变状态也已发展为全病程多次监控，以应对不断变化的病情。循环肿瘤DNA(ctDNA)是药物伴随诊断、反映疾病实时进展的优秀标志物，但其含量少、背景噪音高，对于检测方法有极高的挑战。数字PCR技术具有极好的灵敏度和特异性，搭配通量更高、位点更全、成本更低的检测试剂，将能更全面更快速的解析ctDNA，未来能更好的服务于临床。

近日，沧州中心医院宋翔教授团队和河北中医学院中西医结合肝肾病证研究省级重点实验室楚立教授团队与艾普拜生物合作，对“数字PCR panel检测”技术的各项性能进行了全面的评估，并用临床样本验证了其在ctDNA疗效监测上的实战效果，相关学术成果于2020年8月12发表在British Journal of Cancer杂志上(IF:5.791)。

研究方法: 本研究使用艾普拜生物研发的“dEGFR39”数字PCR panel检测试剂，可单次检测EGFR的39个突变位点，包括L858R、19Del和T790M等常见突变位点，以及L861Q、S768I、G719X、C797S(cis/trans)和20ins等罕见突变位点。本研究收集了30例NSCLC患者的回顾性FFPE组织和33例NSCLC患者的配对组织、血浆样本进行分析。

研究结果:

▼“dEGFR39”试剂分析灵敏度达到0.01%

“dEGFR39”检测试剂具有极高的灵敏度，远超ARMS-PCR方法。该研究比较了预期突变丰度(0.01%、0.05%、0.1%、1%、10%)与实测丰度的线性关系，R2接近1。

▼“dEGFR39”试剂具有更高的血浆游离DNA突变检出率

以33例晚期NSCLC患者的组织样本突变检测结果(ARMS-PCR法)为对照，使用“dEGFR39”试剂盒测试配对血浆样本，T790M的检出率提高了60%。

持续采集33例患者血浆样本，同时用dPCR技术和SuperARMS PCR技术进行检测，“dEGFR39”发现8例患者的13份血浆样本为T790M突变，而SuperARMS PCR仅能检出69%(9份)的T790M突变。

▼“dEGFR39”液体活检指导肺癌个性化治疗，提早数月提示肿瘤进展

在埃克替尼治疗368天的患者P-15血浆中，除了原L858R突变外，dEGFR39已检测到耐药位点T790M的出现，比影像学疾病进展提前121天。类似的，在具有19Del突变的P-25患者身上，也提前影像学43天观测到耐药突变位点的出现。患者P-23中，随着埃克替尼的治疗，dEGFR39检测到的L858R的突变丰度不断下降，CT也显示患者治疗有效。之后发现T790M丰度上升，及时更换治疗方案后患者病情又趋于稳定。

优势:

基于Naica数字PCR技术的“dEGFR39”panel检测方法可靠、灵敏、快速、位点多，在预测EGFR-TKIs治疗后的耐药、治疗监控及临床预后等方面体现了明显的优势。